～略～と、言っていますが、列車アイコンご利用規程で、著作権はcuroka(管理人)に属します。Scratchについては、プログラミングの第一歩を応援したいため、ご利用制限しておりません。ただし、Scratchライセンス条項に関するトラブルは、一切責任を負いませんので、自己責任でお願いしております。はScratchについて理解できているので使っても良いはずです。ただ、「自己責任でお願いしております。」と書いてあるので、自己責任で、ということだと思います。
各車＆ヘッドマークの肖像権著作権は鉄道各社に属します。と、書かれていて、その鉄道各社が利用許可を出しているのかが不透明なのでもし利用許可を出していなかったら使えないので使わないのが無難だと思います。
理解していなかったらすみません
長文失礼しました。